El programa tiene convenios con la Secretaría de Salud y Secretaría de Educación del estado de Jalisco.
A nivel nacional con las siguientes universidades: Universidad Nacional Autónoma de México (Facultad de Psicología y Facultad de Estudios Superiores Zaragoza), Universidad Veracruzana (Instituto de Salud Pública), Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Instituto Nacional de Psiquiatría Ramón de la Fuente Muñiz, entre otros.
A nivel internacional con las siguientes universidades: Universidad de Granada, España, Universidad Autónoma de Madrid, Universitat de Barcelona, Universidad de La Habana en Cuba, entre otras.
La cooperación con profesores encargados de programas específicos relacionados a la Psicología de la Salud es clave para la integración y fortalecimiento de las Líneas de Aplicación y Generación del Conocimiento de la Maestría.